يعنــى هــذا المختبــر بتدريــب الطلبــة عمليــا علــى أنــواع الفحوصــات المختبريــة الخاصــة بالأحياء المجهريــة وكذلــك اســتخدام المجاهــر للتعــرف علــى الأنواع المختلفــة للبكتريــا والفطريــات والفايروســات واعــداد الأوساط الزراعية المختلفــة لتنميــة هــذه الكائنــات.
